On repeatability and directionality of collateral effects of drug resistance evolution
本論文は、薬剤耐性進化に伴う共抵抗性や感受性などの副次的効果の再現性や方向性を、薬力学と集団遺伝学を統合した枠組みを用いて説明し、薬剤濃度や選択 regimes がこれらのパターンに与える影響を明らかにしたものである。
📄 Category
evolutionary biology
261 件の論文
進化生物学は、生命がどのように時間とともに変化し、多様な姿を形成してきたかを解き明かす分野です。遺伝子の働きから種間の関係まで、過去の証拠と現在の観察を結びつけることで、私たちの存在のルーツに迫ります。
Gist.Science は、bioRxiv から投稿される進化生物学の新しいプレプリントをすべて収集し、専門用語を噛み砕いた解説と、技術的な詳細をまとめた要約の両方をご用意しています。これにより、専門家だけでなく広く一般の方々が、最先端の研究成果をスムーズに理解できます。
以下に、進化生物学の最新プレプリントの一覧をご紹介します。
WINDEX: A hierarchical integration of site- and window-based statistics for characterizing the footprint of positive selection in genome-wide population genetic data
WINDEX は、サイトレベルとウィンドウレベルの統計情報を階層的に統合する新しい手法であり、正の選択の痕跡をより正確に検出・局所化し、全ゲノムにわたる正の選択の割合を推定することを可能にします。
Structural Genomic Variation and Its Potential Role In Deer Speciation
本研究は、長鎖および短鎖リード配列データを用いて解析を行った結果、Odocoileus 属の 2 種における種特異的な構造的変異（SV）が生殖や感覚適応に関連する遺伝子に影響を与え、これらが種分化のメカニズムに関与している可能性を示唆しています。
Genetic architectures of brain-related traits are shaped by strong selective constraints
この論文は、中枢神経系に関連する形質が、他の形質と比較してより強い自然選択の制約を受け、変異の標的サイズが大きく、GWAS における統計的有意性が低いという共通の遺伝的アーキテクチャを持つことを明らかにし、複雑な形質の遺伝的構造がそれを媒介する組織によって形成されていることを示唆しています。
Evolutionarily informed gene sets reveal conserved and lineage-modified transcriptional programs during vertebrate forebrain evolution
本研究は、進化的に情報を与えられた遺伝子セットを用いた11 種の脊椎動物の単一細胞解析により、脊椎動物の前脳が細胞種の安定したアーキテクチャを維持しつつ、進化的に保存された転写プログラムを系統特異的に調整することで進化してきたことを明らかにしました。
Comparison of the Distribution of Fitness Effects Across Primates
この論文は、38 種のカタルヒネ類霊長類におけるアミノ酸置換変異の適応度効果分布（DFE）を推定し、種間差は主に有効集団サイズの違いに起因するものであり、集団サイズが 10 倍増えると強く有害な変異の割合が約 10% 増加すること、また支配性の影響は比較推定に最小限であることなどを明らかにした。
Ancient DNA reveals early use of melons in China's Song Dynasty
中国・宋代のメロンの古代 DNA 解析により、メロンが中国で独立して家畜化されたのではなくアジア由来の栽培種であったこと、そして当時のメロンが甘味のあるデザート用ではなく、緑色の果肉を持つ食用または料理用として利用されていた可能性が示されました。
Tracing mobility among Eneolithic-Bronze Age Kurgan populations in the North Pontic steppe
本研究は、北黒海ステップの4〜3 千年紀のクルガン埋葬者におけるストロンチウム同位体分析などを通じて、同地域内での移動パターンを解明し、北黒海ステップの初となる同位体基準値のヒートマップを作成したものである。
Genomebook: Mendelian inheritance as a structured parameterisation layer for LLM agent populations
本論文は、26 の行動特性を記述するメンデル遺伝モデルを LLM エージェント集団に導入し、選択圧下で遺伝的アーキテクチャが行動の進化を駆動し、非遺伝的ベースラインでは見られない動的変化を生み出すことを実証した「Genomebook」という進化システムの開発を報告するものである。
Inferring the multi-host fitness landscape of endive necrotic mosaic virus from cross-inoculation experiments
この論文は、魚の幾何学モデルとベイズ推論を組み合わせてエンドウモザイクウイルスの多宿主適応度地形を推定し、宿主間の許容性の不均一性や系統関係との一致を明らかにする手法を提案している。